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的多態變異(p.Ser141Ser和p.Arg737Gly)NAGLU基因真的預示著假缺陷等位基因嗎?

beplay怎么下载安装體積45文章編號:60（2019）引用這篇文章

摘要

Filocamo等人最近發表了一篇論文，描述了假缺陷等位基因的存在，該等位基因由p.Ser141Ser和p.Arg737Gly多態性構成NAGLU基因，導致α - n -乙酰- d -葡萄糖苷酶活性水平降低。基於對巴西患者進行的分析，使用定製的基因麵板包含SGSH，NAGLU，HGSNAT而且GNS我們觀察到p.Ser141Ser (rs659497)和p.Arg737Gly (rs86312)變異存在於我們所有的MPS IIIB患者和大多數MPS IIIA、IIIC和IIID患者的純合子中，與沒有“假缺失等位基因”的患者相比，該組的α - n -乙酰- d -葡萄糖苷酶活性沒有顯著降低。因此，我們認為這兩個變異並沒有產生假缺陷等位基因。

給編輯

我們懷著極大的興趣閱讀了Filocamo等人的文章。[1)發表在2018年11月的《意大利兒科雜誌》上。beplay怎么下载安装在這篇手稿中，作者提到分子分析的一個並發症NAGLU基因(與Sanfilippo B綜合征相關或也稱為粘多糖型IIIB)是假缺陷等位基因的存在，該等位基因由p.Ser141Ser和p.Arg737Gly多態性同時構成，這導致α - n -乙酰- d -葡糖苷酶活性水平降低。

在過去的35年裏，我們一直致力於粘多糖(MPS)的診斷，在此期間，1184例巴西患者確診了MPS，其中192例患者受到MPS III的4個亞型之一的影響[2］．作為我們MPS III研究的一部分，在尿液中檢測出硫酸肝素糖胺聚糖後，我們在白細胞中進行了不同的酶活性測定，以達到明確的診斷並確定MPS III亞型[2］．在這一步之後，我們對大約40%的MPS III患者進行了靶向下一代測序(NGS)分析，使用定製的基因麵板包含SGSH，NAGLU，HGSNAT而且GNS它被設計用來同時對這些基因的整個編碼區和內含子-外顯子連接的20pb進行測序。所有病例均檢出致病性變異。因此，我們有廣泛的患者組的生化和分子數據。

根據我們的數據，在NGS分析的所有MPS IIIB患者中，p.Ser141Ser (rs659497)和p.Arg737Gly (rs86312)變異均存在純合狀態。這些患者的酶活性低於參考範圍，通過突變分析證實他們在臨床上受到了MPS IIIB的影響。

另一方麵，我們有其他類型的MPS III (IIIA, IIIC和IIID)患者，這些患者在純合子中出現了據稱導致假缺陷等位基因的相同改變。檢測到這些變異是因為患者具有MPS III的臨床表型，並在用於4種MPS III的相同NGS麵板中進行分析。與正常對照相比，NAGLU酶活性在正常範圍內，見表1．

表1 MPS III患者的基因型和α - n -乙酰- d -葡糖苷酶活性
全尺寸表

土耳其1例MPSIIIA患者和厄瓜多爾2例MPS IIIB患者的純合子中也存在這兩種變異。

在我們的MPS III患者組中，p.Ser141Ser和p.Ar737Gly的等位基因頻率分別為0.9706和0.9412。此外，ExAC(外顯子組聚合聯盟)報道p.Ser141Ser的頻率為0.9947和0.9055 [3.］．此外，巴西突變數據庫(ABraOM)包含了609名健康巴西老年人的外係變異，報告了p.Ser141Ser的602個純合子(0.9942)和p.Arg737Gly的459個純合子(0.8686)[4］．

假缺陷等位基因在溶酶體疾病中並不罕見，包括幾種MPS疾病[5，6，7，8，9，10]，盡管如此，這兩種多態性在全球人群中的高頻率以及這些等位基因的存在並不改變MPS IIIB酶活性的事實表明，這兩種變體並沒有產生假缺陷等位基因。因此，在這兩種變異的存在下，不會檢測到假陽性結果，也不會檢測到蛋白產物的改變或基因表達的變化。

縮寫

ExAC:

外顯子組聚合財團

GNS：

N-acetylglucosamine-6-sulfatase

HGSNAT：

Heparan-Alpha-Glucosaminide N-Acetyltransferase

議員:

黏多醣症

NAGLU：

Alpha-N-acetyl-D-glucosaminidase

門店:

新一代測序

SGSH：

N-sulphoglucosamine sulphohydrolase

參考文獻

  1. 菲洛卡莫M, Tomanin R, Bertola F, Morrone a .黏多糖的生化和分子分析:兒科醫生必須知道的。2018;44(S2):129http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30442161．[引自2019年3月7日]。

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下載參考

確認

不適用。

資金

本研究得到FIPE-HCPA(批準號# 2013-0254)和巴西人口醫學遺傳學研究所(INAGEMP)的部分支持。

DRM由cape博士後獎學金支持。SLS獲得CNPq的研究資助。

數據和材料的可用性

數據共享不適用於本文，因為在當前研究期間沒有生成或分析數據集。

作者信息

作者和聯係

  1. Clínicas阿雷格裏港醫院(HCPA)， Rua Ramiro Barcelos, 2350，阿雷格裏港，RS, 90035-903，巴西

    Diana Rojas Malaga, Sandra Leistner-Segal和Ana Carolina Brusius-Facchin

  2. 遺傳學和分子生物學研究生項目，巴西阿雷格裏港Gonçalves 9500, RS, 91501-970

    戴安娜羅哈斯馬拉加

  3. 醫學研究生課程:醫學科學，南聯邦大學(UFRGS)， Rua Ramiro Barcelos 2400，阿雷格裏港，RS, 90035-003

    Sandra Leistner-Segal和Ana Carolina Brusius-Facchin

作者
  1. 戴安娜羅哈斯馬拉加
    看來作者出版物

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  2. 桑德拉Leistner-Segal
    看來作者出版物

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  3. 安娜卡Brusius-Facchin
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貢獻

DRM和ACBF進行分子遺傳學研究，參與序列比對和NGS解釋。ACBF、DRM和SLS負責流行病學和統計分析。DRM負責起草手稿。SLS構思了這項研究，並參與了它的設計和協調，並幫助起草了手稿。所有作者閱讀並批準了最終稿件。

相應的作者

對應到桑德拉Leistner-Segal．

道德聲明

倫理批準和同意參與

這項研究得到了巴西阿雷格裏港Clínicas醫院的機構倫理委員會的批準，該醫院被人體研究保護辦公室認可為機構審查委員會(IRB0000921)。所有患者均提供書麵知情同意(協議編號2003-0066)。

同意出版

不適用。

相互競爭的利益

作者聲明他們沒有競爭利益。

出版商的注意

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權利和權限

開放獲取本文根據創作共用署名4.0國際許可協議發布(http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)，該協議允許在任何媒體上不受限製地使用、分發和複製，前提是您適當地注明原作者和來源，提供創作共用許可的鏈接，並說明是否有更改。創作共用公共領域奉獻放棄書(http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/)除另有說明外，適用於本條提供的資料。

再版和權限

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引用這篇文章

Rojas Malaga, D.， Leistner-Segal, S. & Brusius-Facchin, A.C.多態變異(p.Ser141Ser和p.Arg737Gly)NAGLU基因是否真的預示著假缺陷等位基因?斜體字J Pediatr4560(2019)。https://doi.org/10.1186/s13052-019-0657-3

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關鍵字

  • NAGLU基因
  • Alpha-N-acetyl-D-glucosaminidase
  • Pseudodeficiency等位基因
  • 禮賓部主管B綜合症

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ISSN: 1824 - 7288

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