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涉及HMGA2基因的12q14.3微缺失導致Silver-Russell綜合征樣表型:一個病例報告和文獻綜述

摘要

背景

西爾-羅素綜合征(SRS)是一種以宮內和產後生長受限和正常頭圍為特征的遺傳疾病,其結果是相對的大頭畸形。成癮的發現是早期前額突出,身體不對稱(上肢和下肢)和大量的進食困難。盡管引起該綜合征的幾種遺傳機製已為人所知,但超過40%的srs樣表型患者仍未得到病因學診斷。在過去的幾年裏,不同的臨床報告表明,基因突變或缺失HMGA2基因可能導致srs樣表型的患者在該綜合征的常見診斷測試結果為陰性。

案例展示

我們報告一個臨床診斷為銀羅素綜合征(SRS)的3歲男性患者,與12號染色體長臂(12q14.3)的新生雜合性缺失有關HMGA2基因。

結論

我們的報告證實了病因的作用HMGA2作為srs樣表型發展中的疾病基因。

背景

西爾-羅素綜合征(SRS)是一種明顯的綜合征性生長障礙,其產前和產後生長失敗與其他特征相關,包括出生時相對大頭畸形、早期前額突出、身體不對稱和大量喂養困難。幾乎所有患有SRS的兒童出生時都是SGA。大多數SRS兒童未見產後追趕生長[1].

多種臨床評分係統已被提出的銀羅素綜合征(SRS)。在他們的前瞻性研究驗證了一個臨床評分係統,並證明了SRS的表型-基因典型相關性, Azzi等人提出了一種新的評分係統(Netchine-Harbison臨床評分係統),處理SRS的調查和診斷流程圖[2].

SRS可由不同的遺傳機製引起。最常見的異常與11p15.5區域或7號染色體的外顯有關。特別是H19/IGF2: g - dmr低甲基化幾乎發生在40%的病例中,其次是7號染色體的母係單係二聚體(4-10%的病例),11p15.5區域的母係單係二聚體(不到1%的病例),以及伴有或不伴有ICR2低甲基化的多位點低甲基化(不到1%的病例)。染色體重排,如母體11p15.5區域的重複和其他隱性染色體畸變,分別報道在不到1%的病例中。然而,在不到60%的SRS病例中可以檢測到所有這些基因畸變,因此臨床診斷仍然沒有遺傳病因[123.45].

在過去的十年裏,一些研究表明HMGA2在SRS表型和SRS經典基因檢測陰性的患者中作為候選基因。HMGA2基因編碼HMGA2蛋白,它是“高遷移群AT-hook”(HMGA)家族的成員。這些蛋白質作為結構轉錄因子,調節幾個基因的轉錄活性。HMGA蛋白在胚胎和間充質幹細胞的早期發育階段表達高,而在成人組織中幾乎不表達或表達極低。此外,一些研究表明它們在脂肪細胞分化中起作用,並在一些腫瘤組織中過度表達[678].

2007年,Menten等人。9]報道了SRS患者的12q14.3區域微缺失,包含不同的基因,包括HMGA2而且LEMD3(一種OMIM致病基因,與Buschke-Ollendorff綜合征和伴有或不伴有肌變骨質增生的骨質疏鬆症相關)。據我們所知,其他三個雜合子致病變異和兩個外顯子缺失涉及HMGA2基因在SRS臨床診斷患者中的表達[8101112].

我們報告了一例SRS表型患者的臨床和遺傳特征,並發現12q14.3區域有一個全新的425 Kb微缺失HMGA2基因,而不是LEMD3基因。

案例展示

我們的病人是一個3歲的男孩,第三個孩子的白種人,非血緣和健康的父母。在一次不尋常的懷孕後,他在懷孕39周時通過自然分娩出生。在出生時,他是小胎齡:體重2350克(<第三百分位),長47厘米(第二百分位),頭周長31厘米(<第三百分位)。他的阿普加評分在1分鍾時為9分,在5分鍾時為10分。他過去的病史很重要,因為在他出生的第一年,他一直未能茁壯成長。幾次檢查均正常,包括代謝和胃腸疾病檢查、多次尿檢、頭顱超聲、心髒超聲和腹部超聲。內分泌檢查顯示生長激素(GH)功能正常,但有中度甲狀腺功能減退,仍使用左旋甲狀腺素治療。8個月時,聽力評估正常,而眼科檢查顯示輕度假性斜視。

他在10個月大的時候被送到我們這裏。其人體測量參數為:體重5900 g (< - 2 SDS),體長64 cm (< - 2 SDS),頭圍43.8 cm(第9 - 25百分位)。此外,體格檢查顯示:三角形,前囟門閉合,額寬,額凸,眼睛深陷,內眥內花,下斜瞼裂,鞏膜藍色,下巴狹窄,有輕微垂直褶皺,耳朵後旋,對螺旋前腳突出,耳屏和對耳屏發育不全,腳第2 /3指並指,手第5指側指,肌肉量低,下肢不對稱(左比右短近1厘米)。要求進行神經精神谘詢,然後檢測到中度語言延遲。大腦核磁共振顯示正常。

2年,臨床表現似乎沒有變化。體重7500 g(<3百分位),左長81 cm,右長80 cm(<3百分位),體重47,3 cm(第10百分位),體重指數11,7(<3百分位)。在我們中心的最後一次檢查中,在3歲的時候,在臨床表現和生長參數方麵沒有發現明顯的變化。體重9450 g(<第3百分位),左側長88 cm,右側長89 cm(第3百分位),HC為482 cm(第3百分位)(圖1)。1).

圖1
圖1

一個bc我們的病人3歲4個月大。注意三角形,前額寬,前額凸,眼睛深陷,內眥花皮,下斜的瞼裂,狹窄的下巴和輕微的垂直折痕,耳朵向後旋轉,花皮前腳突出,耳屏和反耳屏發育不全

應用Netchine-Harbison CSS (NHCSS),我們得到5/6分(先證者符合所有可能的SRS標準,除了出生時相對頭大畸形)[2].

基因檢測

根據NHCSS評估的SRS的臨床懷疑,我們按照Azzi等人提出的流程圖進行了該綜合征的經典基因檢測。印跡區11p15的甲基化特異性多重傳代依賴探針擴增(MS-MLPA)未發現介導損失(LOM), 7號染色體微衛星標記的研究未發現單代二染色體組(UPD)。隨後,按照上述流程圖,我們繼續使用Array-CGH (Array-Comparative Genome Hybridization,陣列-比較基因組雜交)進行全基因組微缺失或微重複的研究。該分析顯示,12號染色體長臂從序列上末端探針缺失最多的66358,287位置(細胞遺傳位點12q14.3)到66782,791(細胞遺傳位點12q14.3)發生部分從頭缺失,大小為425 kb(圖)。2).根據構建UCSC基因組瀏覽器(Hg build 19),有幾個基因存在於這個區域,包括OMIM致病基因HMGA2 (OMIM 600698,部分參與)、IRAK3 (OMIM 604459)和GRIP1 (OMIM 604597)。這個微缺失在DECIPHER中沒有報道。然而,同一數據庫記錄了1.67 Mb的刪除(ID 337828),意義不明,包括相同的基因和母親遺傳,在一名有偶發性多汗症、發育不良、中等身材矮小、麵部不對稱、前額突出、突出、脊柱側凸和宮內發育遲滯史的女嬰中發現。Heldt等人先前在一個家族中描述了具有相同基因組和臨床特征(大小、基因組坐標、母體來源、臨床圖像(無多汗症除外)的缺失,該家族中缺失與Silver-Russell樣表型分離。即使Heldt和數據庫DECIPHER都沒有提及對方報告的案例,我們相信可以合理地得出結論,DECIPHER和Heldt論文中報告的刪除是相同的[213].

圖2
圖2

全基因組陣列cgh分析:第12號染色體長臂缺失425 Kb,範圍從66358287 Mb (12q14.3)到66782791 Mb (12q14.3)

材料和方法

根據製造商說明,使用QIAamp DNA血液Midi試劑盒(Qiagen Inc., Valencia, CA)提取先證者及其父母的DNA。正常對照是一隻商業上可以買到的雄性Promega (Promega Corporation, Madison, WI)。陣列CGH分析使用人類基因組CGH微陣列試劑盒8x60K(安捷倫),根據製造商的說明,分辨率為100 - 150kb。陣列切片用Agilent G2505B掃描儀分析。使用CytoGenomics 3.0.6.6軟件(安捷倫技術公司,聖克拉拉,加州)對圖像進行分析和可視化。

討論與結論

超過40%的srs樣表型患者仍未得到病因學診斷[3.4].有幾個基因被提出作為候選基因。在過去的10年裏,不同的報告提出了HMGA2srs樣表型的病因學研究。據我們所知,隻有28例srs樣表型是由於單倍體不足HMGA2的報告(表1).特別地,我們描述了用a-CGH檢測到的23個缺失。其餘5例為:7bp缺失[11,一個無義變體和一個移碼變體[102個外顯子2缺失[12外顯子1-2個[8].迄今為止描述的23個缺失範圍在387 kb到10.12 Mb之間,涉及其他相鄰基因[9121314151617181920.212223].盡管這些刪除的大小是可變的,但已經確定了一個2.61 Mb的臨界區域。該區域包含的OMIM疾病致病基因為:LEMD3(607844年人類),MSRB3(613719年人類),HMGA2(600698年人類),IRAK3(604459年人類),GRIP1(人類604597)。

表1文獻中描述的HMGA2單倍不足導致srs樣表型的所有病例總結

HMGA2該基因編碼HMGA2蛋白,HMGA家族的成員。這個家族的四種蛋白質(HMGA1a, HMGA1b, HMGA1c和HMGA2)由兩個基因(HMGA1而且HMGA2),可與DNA相互作用,改變其構象,並調節多個基因的轉錄。HMGA2調節已知的胎兒生長因子IGF2的轉錄。在人類和動物模型上的多項研究表明HMGA2在胎兒期,它可能在胚胎發育和線性生長中起關鍵作用。此外,HMGA2在調節細胞生長、增殖、分化和死亡,促進脂肪細胞分化中起重要作用。表達的HMGA2也曾在一些腫瘤組織中發現(子宮平滑肌瘤、胃癌、小兒脂肪瘤)[6781224252627].這些實驗研究,加上文獻報道的臨床數據,在證明的關鍵作用HMGA2產前和產後生長障礙和發育障礙的改變是無法解釋的。

正如之前報道的,LEMD3是Buschke-Ollendorff綜合征和伴有或不伴有黑色素增生的骨質疏鬆症(OMIM 166700)的致病基因。所有具有此綜合征特征的患者均攜帶有涉及也的缺失LEMD3,由表中的數據可知1(見上標和注釋)。

對於包含在關鍵區域的其他OMIM疾病致病基因,雙等位基因突變在MSRB3在耳聾常染色體隱性遺傳74 (OMIM 613718)的病例中有描述的基因,而在一些多態IRAK3與哮喘易感性增加有關。的GRIP1基因被稱為弗雷澤綜合征隱性遺傳的致病基因,在大多數攜帶12q14.3缺失的患者中被認為是神經發育障礙的候選基因。這一假設源於其在胎兒期和產後腦組織中的高表達,以及其在突觸功能中的明確作用。然而,發育障礙,如語言和/或運動遲緩,學習困難和智力障礙,也被描述為不涉及12q14.3缺失的患者GRIP1基因(1523].

的專屬角色HMGA2SRS的典型特征(Netchine-Harbison CSS的前兩項)是先天和產後生長失敗和體重不足,這一特征在所有攜帶不同畸變的SRS患者中均有描述HMGA2不管它們的維度是什麼。事實上,12q14.3區域多或少廣泛缺失(涉及多個基因,如HMGA2的致病性變異或基因內缺失的患者HMGA2.此外,最近一份副本涉及HMG2A據報道,在一個過度生長、肥胖和高身材的骨齡患者中[28,確認了…的作用HMGA2基因調節生長。

關於文獻中描述的患者的其他臨床特征(見表1)、相對頭大畸形和前額突出,這是我們的患者出現的NHCSS的另外兩個項目,據我們所知,文獻中描述的病例不到一半。NHCSS的另一項,身體不對稱,似乎不是12q14.3微缺失綜合征的典型特征,但在我們的先證中報告了它,他有下肢不對稱。到目前為止,我們的病例代表唯一一個12q14.3微缺失綜合征肢體不對稱。最後,在沒有其他神經發育障礙的情況下,患者表現出中度語言延遲。神經發育障礙(語言和/或運動遲緩、學習困難、智力障礙、行為問題)的出現似乎是12q14.3微缺失綜合征的一個明顯和頻繁的特征,據報道約有一半的患者出現這種症狀(見表)1) [2].

總之,我們建議進行調查HMGA2所有SRS喚起表型和MS-MLPA印跡區11p15和7號染色體微衛星標記陰性遺傳結果患者的基因。為了完成SRS的診斷工作,我們推薦陣列cgh分析,然後是序列分析和MLPAHMGA2基因。

數據和材料的可用性

本研究中使用和/或分析的數據集可根據合理要求從通訊作者處獲得。

縮寫

SRS:

Silver-Russell綜合症

SD:

標準差

核磁共振成像:

磁共振成像

MS-MLPA:

定向定向多重傳代依賴探針擴增

LOM:

失去的Metilation

烏利希期刊指南:

單性生殖的二體性

a-CGH:

Array-Comparative基因組雜交

參考文獻

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下載參考

確認

我們要感謝患者家屬,以及所有參與這項研究的人員。

資金

作者聲明這項工作沒有資金支持。

作者信息

作者和聯係

作者

貢獻

FM、MB和MP在數據的概念和設計、數據的獲取以及數據的分析和解釋方麵都做出了巨大的貢獻。MM進行了陣列cgh分析。FM和MB撰寫了手稿。TF和MP對稿件進行了審閱和修改。FM、MB、ES、DP、MP參與遺傳診斷和護理。所有作者閱讀並批準了最終稿件。

相應的作者

對應到瑪蒂娜Buse

道德聲明

倫理批準和同意參與

本病例報告中描述的患者父母簽署了參與研究的書麵知情同意書。

同意出版

獲得了患者父母的書麵知情同意,以便公布醫療數據、基因檢測結果和識別圖像。

相互競爭的利益

作者聲明他們沒有競爭利益。

額外的信息

出版商的注意

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權利和權限

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引用這篇文章

梅爾卡丹特,F. Busè, M.薩爾紮諾,E。et al。涉及HMGA2基因的12q14.3微缺失導致Silver-Russell綜合征樣表型:一個病例報告和文獻綜述。斜體字J Pediatr46108(2020)。https://doi.org/10.1186/s13052-020-00866-9

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關鍵字

  • Silver-Russell綜合症
  • 未能茁壯成長
  • HMGA2基因
  • Netchine-Harbison臨床評分係統
  • 病例報告
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